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Workflow
TOGO
統合DB情報基盤サイト
http://togo.cbrc.jp/
ALN
ALN
2つの配列または配列グループ間を
アラインメントするプログラム
http://www.cbrc.jp/ALN/
CentroidFold
CentroidFold
RNA二次構造予測ソフトウェア
http://www.ncrna.org/centroidfold/
GUPPY
GUPPY
遺伝子配列におけるデータの意味を註釈した
情報を表示できるプログラム
http://www.cbrc.jp/GUPPY/
LAST
LAST
大規模ゲノム配列比較ソフトウェア
http://last.cbrc.jp/
MAFFT
MAFFT
多重配列アラインメントプログラム
http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/
Murlet
MURLET
構造RNAのマルチプルアライメント
プログラム
http://murlet.ncrna.org/
paraclu
paraclu
配列に付属するデータの中からクラスターを
発見するプログラム
http://www.cbrc.jp/paraclu/
Rfold
Rfold
長いDNA配列の局所的な塩基対確率を
計算するソフトウェア
http://www.ncrna.org/software/rfold/
seg-suite
seg-suite
配列セグメントとアラインメントを
操作するツール
http://www.cbrc.jp/seg-suite/
Spaln
tantan
転写産物(EST, cDNA, アミノ酸)のゲノムへのマッピングとスプライシングを考慮したアラインメント
http://www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp
/~aln_user/spaln/
tantan
tantan
核酸及びアミノ酸配列から、機能が未知の
リピート配列を検出する。
http://www.cbrc.jp/tantan/
CellMontage
CellMontage
マイクロアレイデータ検索・解析システム
http://cellmontage.cbrc.jp/
SAMURAI
SAMURAI
遺伝子モジュールを高速かつ網羅的に
列挙するプログラム
http://samurai.cbrc.jp/
FORTE
FORTE
プロファイル比較による
タンパク質立体構造認識法
http://www.cbrc.jp/forte/
GRIFFIN
GRIFFIN
GPCRーGタンパク質結合選択性
予測システム
http://griffin.cbrc.jp/
GRIP
GRIP
GPCR多量体化インターフェイス予測ツール
http://grip.cbrc.jp/GRIP/
POODLE
POODLE
タンパク質ディスオーダー予測
http://mbs.cbrc.jp/poodle/
TMBETA-NET
TMBETA-NET
膜貫通タンパクのベータストランド予測
をするプログラム
http://psfs.cbrc.jp/tmbeta-net/
WoLF PSORT
WoLF PSORT
タンパク質細胞内局在化予測ソフト
http://wolfpsort.org
ScreenCap3
ScreenCap3
Caspase-3の基質とcleavage siteの予測
http://scap.cbrc.jp/ScreenCap3/
MitoFates
MitoFates
ミトコンドリアタンパク質のプレ配列と cleavage site の予測
http://mitf.cbrc.jp/MitoFates/
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