セミナー実績（2011年度）
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回数の欄にリンク [HPCI] 表示があるセミナーは HPCIセミナー(2011/10/07〜2012/01/13)を兼ねており、 そのスケジュール・内容等はすべて公開されています。（誰でも聴講可） ＞＞ HPCIセミナー  ・・・この印のついたセミナーは、どなたでも聴講可能な公開セミナーです。（事前申込不要）会場への入室等、詳しい聴講方法はこちらをご覧ください。 ＞＞ 聴講方法  ・・・タイトルの後ろにこの印のついたセミナーは、英語による発表です。
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| 回 | スケジュール | タイトル | 発表者 |
|---|---|---|---|
| 第47回 | 03/29/(木) 11:00〜 |
データの共有・再利用と「生命科学系データベースアーカイブ」 | 畠中 秀樹 （科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター） |
| 第46回 | 03/23/(金) 14:00〜 |
Transposon Tales: Genome-wide analyses unravel the story of their evolution |
Elizabeth Henaff (Center for Research in Agricultural Genomics) |
| 第45回 | 03/22/(木) 14:00〜 |
X線結晶構造から観る無脊椎動物ロドプシンの光反応過程 | 村上 緑 （名古屋大学大学院理学研究科物理学教室 助教） |
| 第44回 | 03/16/(金) 14:00〜 |
RNA−タンパク質相互作用におけるRNA2次構造とタンパク質表面形状の役割 | 岩切 淳一 （宮崎大学 フロンティア科学実験総合センター） |
| 第43回 | 03/15/(木) 16:00〜 |
Finding speedup using data flow computing |
Michael Flynn |
| 第42回 | 03/15/(木) 14:00〜 |
木差分計算のソフトウェア進化解析への応用 | 森 彰 （産総研 社会知能技術研究ラボ 主任研究員） |
| 第41回 | 03/05/(木) 10:30〜 |
Combinatorial motif analysis of regulatory gene expression in Mafb deficient macrophages（Mafb欠損マクロファージにおける遺伝子発現制御の組合せモチーフ解析法） | 森田 眞理子 （筑波大学大学院人間総合科学研究科生命システム医学専攻 ） |
| 回 | スケジュール | タイトル | 発表者 |
|---|---|---|---|
| 第40回 | 03/02/(金) 14:00〜 |
MixSIH: a mixture model for single individual haplotyping | 松本 拡高 （東京大学 木立研究室） |
| 第39回 | 02/23/(木) 14:00〜 |
Read error correction and Transcriptome analysis with High throughput sequencing data |
Hugues Richard ( Assistant professor, the University Pierre and Marie Curie ) |
| 第38回 | 02/16/(木) 14:00〜 |
Draft genome analysis provides the design for producing highly neutral lipid in marine pennate diatom, *Fistullifera* sp. JPCC DA0580 | 田中 道廣 （細胞機能設計チーム） |
| 第37回 | 02/10/(金) 14:00〜 |
Evolutionary analysis of 3'UTR in the C.elegans genome.（線虫Caenorhabditis elegansゲノムの３’非翻訳領域の進化解析） | 市原 寿子 （生体分子システム 研究班） |
| 第36回 | 02/09/(木) 14:00〜 |
Functional Modules in Druggable GPCR-GPCR interaction Network | 根本 航 (分子機能計算チーム） |
| 第35回 | 02/03/(金) 15:00〜 |
Large-scale similarity search for noncoding RNAs using sequence kernels and locality-sensitive hashing | 齋藤 裕 （慶應義塾大学 理工学部 生命情報学科 理工学研究科 基礎理工学専攻 生命システム情報専修） |
| 第34回 | 01/20/(金) 14:00〜 |
Tertiary structure prediction of RNA molecules using short single-stranded fragment structures | 山崎 智 （分子機能計算チーム） |
| 第33回 | 01/19/(木) 14:00〜 |
Sequence Analysis of Outer Membrane Proteins of Mitochondria-related Organelle, Mitosome in E. histolytica | 今井 賢一郎 （配列解析チーム） |
| 第32回 [HPCI] |
1/13/(金) 14:45〜 |
計算システム生物学的アプローチによる疾患要因遺伝子候補の絞り込み法 [Abstract PDF] | 堀本 勝久 (生体ネットワークチーム) |
| Development of Infrastructure Technologies for Bioinformatics Information [Abstract PDF] | 福井 一彦 (分子機能計算チーム) |
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| 第31回 [HPCI] |
12/16/(金) 14:45〜 |
創薬インフォマティクスによる医薬品探索 [Abstract PDF] | 広川 貴次 (創薬分子設計チーム) |
| Development of structure prediction pipeline for eukaryotic proteins and SAHG database [Abstract PDF] | 本野 千恵 (創薬分子設計チーム) |
| 回 | スケジュール | タイトル | 発表者 |
|---|---|---|---|
| 第30回 | 12/12/(月) 14:00〜 |
ORTHOGONAL-RAY GRAPHS |
Anish Shrestha (東京工業大学) |
| 第29回 [HPCI] |
12/9/(金) 14:45〜 |
遺伝子発現の時系列解析 [Abstract PDF] | 富永 大介 (細胞機能設計チーム) |
| 創薬技術としての分子動力学法 [Abstract PDF] | 亀田 倫史 (創薬分子設計チーム) |
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| 第28回 | 12/7/(水) 15:00〜 |
Quantification of circulating effects in input-output analysis | 森岡 涼子 (機械学習研究班) |
| 第27回 [HPCI] |
12/2/(金) 14:45〜 |
遺伝子発現データからのネットワーク推定 [Abstract PDF] | 油谷 幸代 (細胞機能設計チーム) |
| 幹細胞インフォマティクスと創薬 [Abstract PDF] | 藤渕 航 (細胞機能設計チーム) |
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| 第26回 | 11/30/(水) 15:00〜 |
暗号プロトコルを用いたプライバシ保護データマイニング | 荒井 ひろみ （筑波大学 研究員） |
| 第25回 [HPCI] |
11/25/(金) 14:45〜 |
生体高分子の分子シミュレーション - 計算機支援創薬にむけて - [Abstract PDF] |
末永 敦 (分子機能計算チーム) |
| 第24回 [HPCI] |
11/18/(金) 14:45〜 |
酵素の立体構造と触媒機能 [Abstract PDF] | 長野 希美 (生体分子システム研究班) |
| 高速検索技術のバイオインフォマティクスへの応用 [Abstract PDF] | 津田 宏治 (機械学習班) |
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| 第23回 |
11/14/(月) 14:00〜 |
Single molecule manipulation of RNA under applied force: a quantitative approach to analyzing molecular tweezers experiments |
Wayne Dawson (東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻) |
| 第22回 [HPCI] |
11/11/(金) 14:45〜 |
哺乳類ゲノムに保存されたRNA構造因子の網羅的探索 [Abstract PDF] | 光山 統泰 (RNA情報工学チーム) |
| タンパク質発現・可溶性予測法とタンパク質ディスオーダー領域予測法 [Abstract PDF] | 野口 保 (主幹研究員) |
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| 第21回 | 11/11/(金) 13:30〜 |
リボソーム改変を起点とした微生物システムの解明 | 宮崎 健太郎 (産総研 生物プロセス研究部門 酵素開発研究グループ（北海道センター）) |
| 回 | スケジュール | タイトル | 発表者 |
|---|---|---|---|
| 第20回 [HPCI] |
11/04/(金) 14:45〜 |
Multiple Sequence Alignment [Abstract PDF] | 加藤 和貴 （大阪大学 免疫学フロンティア研究センター 特任准教授） |
| Analysis of Protein-Protein Interaction with Multiple Amino Acid Sequence Alignment [Abstract PDF] | 藤 博幸 （副研究センター長／生体分子システム研究班） |
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| 第19回 [HPCI] |
10/28/(金) 14:45〜 |
All pairs similarity search in edit distance. [Abstract PDF] | 清水 佳奈 (RNA情報工学チーム) |
| Cross profile analysis and its applications [Abstract PDF] | 富井 健太郎 (配列解析チーム) |
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| 第18回 | 10/25/(火) 16:00〜 |
Phenotype-specific network biology from data integration |
Soren Brunak （デンマーク工科大学 教授） |
| 第17回 [HPCI] |
10/21/(金) 14:45〜 |
Pair-wise Sequence Comparison: Old and New Solutions [Abstract PDF] [Slide PDF] |
マーティン・フリス (配列解析チーム) |
| 第16回 [HPCI] |
10/14/(金) 14:45〜 |
Perlによるfastq,fasta形式データの処理 [Abstract PDF] | ポール・ホートン (配列解析チーム) |
| 嗅覚システムの統合的理解にむけて [Abstract PDF] | 諏訪 牧子 (主幹研究員) |
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| 第15回 | 10/11/(火) 15:00〜 |
Improving Gene Regulatory Networks Inference using Network Motifs with Time
Course Expression Data |
Dave duVerle (京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセン ター) |
| 第14回 [HPCI] |
10/07/(金) 16:00〜 |
開講に当たって | 浅井 潔 (CBRC 研究センター長／ 東京大学大学院新領域創成科学研究科) |
| RNA 二次元構造の熱力学的エントロピーを計算するアルゴリズムについて [Abstract PDF] | 木立 尚孝 (東京大学大学院新領域創成科学研究科) |
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| Maximizing Expected Accuracy Estimations in Bioinformatics [Abstract PDF] | 浜田 道昭 |
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| 第13回 | 10/03/(月) 14:00〜 |
Exploring the fold space of membrane proteins [Abstract PDF] |
Dmitrij Frishman (Technische Universitaet Muenchen, Germany) |
| 第12回 | 09/30/(金) 14:00〜 |
ISMB/ECCB 2011参加報告 [Abstract PDF] | 清水佳奈(RNA情報工学チーム)、富井健太郎(配列解析チーム)、ポール ホートン(配列解析チーム)、本野千恵(創薬分子設計チーム) |
| 第11回 | 09/02/(金) 14:00〜 |
Next Generation Protein 3D Structure Analysis: Rapid Global/Local Surface Comparison, Docking and Low-Resolution Data [Abstract PDF] | Daisuke Kihara (Purdue University, USA) |
| 回 | スケジュール | タイトル | 発表者 |
|---|---|---|---|
| 第10回 | 07/01/(火) 14:00〜 |
SVRによる幹細胞の分化予測 | 千葉 啓和 (細胞機能設計チーム) |
| 第9回 | 06/29/(水) 14:30〜 |
Privacy Preserving Semi-Supervised Learning for Labeled Graphs [Abstract PDF] | 荒井 ひろみ (筑波大学 研究員) |
| 第8回 | 06/24/(金) 14:00〜 |
Next-generation genome alignment with LAST [Abstract PDF] | Paul Horton (配列解析チーム) |
| 06/24/(金) 14:30〜 |
SlideSort: Fast and exact algorithm for Next Generation Sequencing data analysis [Abstract PDF] | 清水 佳奈 (RNA情報工学チーム) |
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| 第7回 | 06/23/(木) 15:00〜 |
Probabilistic Models in Next-Gen Sequence Analysis [Abstract PDF] |
Timo Lassmann (理化学研究所) |
| 第6回 | 06/17/(金) 14:00〜 |
Analysis of mitochondrial localizing mRNA [Abstract PDF] | 崎山 則征 (配列解析チーム) |
| 第5回 | 06/10/(金) 13:45〜 |
microRNAによるターゲット遺伝子抑制効果をマイクロアレイデータから抽出する手法の開発 | 寺井 悟朗 (RNA情報工学チーム、株式会社インテック) |
| 第4回 | 06/09/(木) 14:00〜 |
Reverse engineering of genetic regulatory networks |
Jean-Francois Pessiot (細胞機能設計チーム) |
| 第3回 | 06/03/(金) 14:00〜 |
Hadoopを用いた次世代シーケンサデータ解析システムの紹介 | 吉澤 亜耶 (分子機能計算チーム、株式会社インテック) |
| 第2回 | 04/22/(金) 14:00〜 |
個人情報の知識発見への応用とプライバシ保護 | 佐久間 淳 (筑波大学 准教授) |
| 第1回 | 04/21/(木) 14:00〜 |
アデノシン A2a 受容体と機能性抗体の共結晶構造 | 村田 武士 (千葉大学・理／JST・岩田ERATO) |